KIMUX: Paket Aplikasi Kimia - Linux

KiGOS = Kimia Goes Open Sources
Download:
http://repo.unnes.ac.id/iso/kimux/

Kimux 1.01 hydrogen adalah rilis perdana paket aplikasi kimia linux yang merupakan remastering distro Ubuntu 11.04. Kimux ini dibuat untuk membantu para pengguna pemula linux yang tidak ingin direpotkan dengan instalasi linux dan aplikasi kimia yang begitu banyak. Hanya dengan instalasi Kimux maka akan diperoleh paket linux beserta aplikasi kimia yang tinggal pakai.
Pengembangan sekarang ini sudah sampai edisi Kimux 1.02 hydrogen yang merupakan perbaikan dan penambahan aplikasi dari edisi sebelumnya.

Bulan Agustus 2012 rilis edisi baru yaitu Kimux BlankOn Rote, berisi lebih dari 30 software kimia yang berasal dari repository BlankOn Rote 8.0. Pada perkembangan selanjutnya akan ditambahkan software kimia yang berasal dari luar repository Debian/Ubuntu/BlankOn tetapi tetap 'free and open source software (FOSS).

Silahkan Download file image ISO Kimux dari link ini: Kimux

Selasa, 12 November 2013

Kimux 13.10, Remaster Ubuntu 13.10

Mengikuti rilis Ubuntu 13.10 pada tanggal 17 Oktober 2013, maka telah disusun juga dalam format remaster berupa Kimux 13.10. Seperti rilis sebelumnya, Kimux 13.10 juga berisi paket aplikasi kimia dan standar isi Ubuntu. Sebenarnya rencana semula Kimux tahun 2013 ini mau berbasis BlanKon 9, tapi ditunggu-tunggu tidak kunjung datang, jadi capeee dehhh! Maka diganti dengan Ubuntu 13.10. Rilis Kimux 13.10 berukuran kurang lebih 2,5 GB sudah sukses dijalankan sebagai Live USB, sukses dipakai untuk memasang Kimux 13.10 ke laptop, sukses juga diremaster lagi untuk mendapatkan file ISO lalu dipasang lagi ke Flashdisk menggunakan Unetbootin. Semua itu sudah diuji oleh mahasiswa Jurusan Kimia FMIPA UNNES yang mengikuti perkuliahan "Program Komputer Untuk Pembelajaran Kimia Berbasis ICT". Tunggu selesai uploadnya ke http://repo.unnes.ac.id/iso/kimux.

Rabu, 31 Oktober 2012

Desktop Kimux BlankOn Rote 8.0 (final)
Desktop Kimux BlankOn Rote 8.0 (final)
Akhirnya Kimux BlankOn Rote 8.0 rilis final juga. Remaster BlankOn Rote 8.0 khusus aplikasi kimia ini disuguhkan kepada khalayak kimiawan khususnya dan pecinta linux umumnya.

Isi umum: Isi standard BlankOn Rote 8.0 DVD
Isi utama: Software aplikasi kimia
Isi tambahan: Remastersys, virtualBox dan Editor pemrograman


Software tambahan diantaranya adalah 
  1. openmx yaitu Package for nano-scale material simulations, 
  2. abinit = A package for electronic structure calculations, 
  3. jmol = software editor struktur berbasis java, 
  4. rasmol = viewer molekul 3D, 
  5. avogadro = Molecular Graphics and Modelling System metode MM, 
  6. autodock =analysis of ligand binding to protein structure, 
  7. ballview = A free molecular modeling and molecular graphics tool, 
  8. kalzium = periodic table and chemistry tools for KDE, 
  9. gabedit=graphical user interface to Ab Initio packages, 
  10. gamgi=construct, view and analyse atomic structures, 
  11. gausssum=parse and display Gaussian, GAMESS, and etc's output, 
  12. gdpc=visualiser of molecular dynamic simulations, 
  13. gromacs=Molecular dynamics simulator, with building and analysis tools, 
  14. mopac7-bin=Semi-empirical Quantum Chemistry Library (binaries), 
  15. psi3=Quantum Chemical Program Suite, 
  16. pymol=Molecular Graphics System, 
  17. science-chemistry=Debian Science Chemistry packages, 
  18. v-sim=Visualize atomic structures, 
  19. xbs=3-d models and movies of molecules, 
  20. bkchem=Chemical structures editor dan 

   + ... puluhan software sejenis dan sekualitas software berbayar ...

Iso Kimux BlankOn Rote 8.0 telah lulus uji penggunaan di VirtualBox, LiveUSB dan Live Installer.


Download di:

Kamis, 03 November 2011

Tampilan awal Blankon-Kimux 1.02 hydrogen, hasil remastering BlankOn Pattimura 7.0, kapasitas 2,9 GB. Sukses diujicoba di virtualbox ose, sukses sebagai LiveUSB Flashdisk dan di-install ke harddisk. Berisi lebih banyak lagi aplikasi software kimia tambahan ...

Jumat, 21 Oktober 2011

Daftar Rilis Kimux

Remastering Ubuntu 11.04:
1) Kimux 1.0 hydrogen perdana (2,1GB)
2) Kimux 1.01 hydrogen update-1 (2,2GB)
3) Kimux 1.01 hydrogen update-2 (2,7GB)
4) Kimux 1.02 hydrogen (3,6GB)


Remastering Ubuntu 11.10
1) Kimux 2.0 helium


Remastering Blankon Pattimura 7,0
1) Blankon Kimux 1.00 hydrogen (1,3 GB)

2) Blankon Kimux 1.01 hydrogen (1,7 GB)
3) Blankon Kimux 1.02 hydrogen (2,9) GB)

Kamis, 13 Oktober 2011

Pengenalan Bazaar

Bazaar (disingkat menjadi bzr) adalah salah satu aplikasi Version Control System (VCS) seperti halnya Subversion (svn), CVS, dan git. Berbeda dengan Subversion atau CVS yang bersifat terpusat, Bazaar memiliki sifat terdisitribusi seperti halnya git. Karene bersifat terdistribusi, maka tidak diperlukan satu buah server utama yang berisi informasi seluruh revisi yang pernah dilakukan. Seluruh informasi revisi akan selalu ada pada salinan repositori yang dibuat.

Menggunakan Bazaar

Operasi-operasi dasar
  1. Membuat repositori (init)
  2. Menambahkan berkas atau direktori (add)
  3. Menyimpan perubahan pada repositori (commit)
  4. Menyalin sebuah repositori ke repositori lokal (branch)
  5. Mengirim perubahan pada repositori lokal ke repositori lain (push)
Operasi tambahan
  1. Membuat tag
  2. Mengecek status berkas
  3. Mengatur nama dan email
  4. Melihat perubahan antar revisi

Membuat Repositori

Untuk menggunakan Bazaar, diperlukan adanya repositori kode sumber yang akan menampung seluruh perubahan yang dilakukan. Pembuatan repositori ini dilakukan dengan cara.
$ bzr init
Perintah tersebut akan membuat repositori pada direktori kerja yang aktif. Repositori dapat dikenali dengan adanya direktori .bzr. Direktori repositori ini berisi informasi bagi seluruh berkas pada direktori dan seluruh sub direktori kerja. Seluruh informasi terdapat dalam satu buah direktori ini dan tidak tersebar di seluruh direktori yang ada seperti halnya pada Subversion.
Jika ingin menggunakan fasilitas tagging, tambahkan opsi --dirstate-tags pada saat membuat repositori.
$ bzr init --dirstate-tags
Dengan mengizinkan pembuatan tag, setiap revisi dapat diberi tanda khusus berupa nama yang mudah diingat. Sehingga tidak hanya berupa nomor revisi saja.
Repositori Bazaar yang digunakan untuk menampung berkas-berkas paket untuk BlankOn menggunakan jenis repositori dengan fasilitas tagging seperti ini.

Menambahkan Berkas

Berkas maupun direktori yang ada di dalam direktori kerja tidak serta-merta menjadi berkas/direktori yang tercatat dan tersimpan di dalam repositori. Agar berkas/direktori tersebut dapat tersimpan di dalam repositori, maka berkas/direktori tersebut harus ditandai terlebih dahulu.
Untuk menandai berkas/direktori agar dapat disimpan di dalam repositori, dapat digunakan perintah berikut.
$ bzr add berkas1 berkas2 direktori1 direktori2 ...
Pemanggilan perintah di atas hanya bertujuan untuk menandai saja. Tidak bertujuan untuk benar-benar menyimpan berkas ke dalam repositori. Untuk menyimpannya, silakan baca bagian berikutnya.

Menyimpan Perubahan

Setiap berkas yang sudah ditandai akan dipantau. Jika berkas tersebut mengalami perubahan, maka perubahan akan disimpan ke dalam repositori. Untuk menyimpan perubahan, gunakan perintah berikut.
$ bzr commit
Sebuah editor teks akan terbuka dan Anda diberi kesempatan untuk menuliskan catatan perubahan yang Anda lakukan. Tulis catatan dengan baik dan jelas sehingga rekan kerja Anda dapat memahami perubahan yang Anda lakukan.
Jika Anda ingin melakukan penyimpanan dan penulisan catatan dalam satu langkah, gunakan perintah berikut.
$ bzr commit -m "Catatan perubahan yang terjadi"

Menyalin Repositori

Karena Bazaar bersifat terdistribusi, maka setiap operasi penyalinan akan menyalin seluruh repositori yang ada. Hal ini berarti Anda juga akan mendapatkan seluruh informasi revisi yang pernah dilakukan sebelumnya.
Untuk menyalin repositori, gunakan perintah berikut.
$ bzr branch url://menuju/repositori
Contoh:
$ bzr branch http://bazaar.launchpad.net/~blankon-pemaket/blankon/blankon-artwork
Dengan melakukan perintah di atas, repositori blankon-artwork di launchpad.net akan disalin ke komputer Anda.

Mengirim Perubahan

Ada kalanya Anda ingin mengirim perubahan yang telah Anda simpan dalam repositori lokal ke sebuah repositori lain. Sebagai contoh, Anda ingin mengirim perubahan yang Anda lakukan ke repositori Bazaar yang ada di launchpad.net.
Untuk melakukan hal tersebut, perintah berikut dapat digunakan.
$ bzr push url://menuju/repositori
Contoh:
$ bzr push bzr+ssh://bazaar.launchpad.net/~blankon-pemaket/blankon/blankon-artwork/

Membuat Tag

Jika Anda menggunakan jenis repositori yang mendukung pembuatan tag, maka Anda dapat memberi nama pada setiap revisi yang ada. Perintah untuk melakukan hal tersebut adalah sebagai berikut.
$ bzr tag nama-tag
Tag yang dibuat akan diberikan kepada revisi terakhir yang ada. Jadi, jika Anda ingin memberi tag pada perubahan yang telah Anda lakukan, pastikan Anda melakukan operasi commit terlebih dahulu.

Mengecek Status

Untuk melihat status dari setiap berkas atau direktori yang ada pada direktori kerja, Anda dapat menggunakan perintah berikut.
$ bzr status
Jika ada berkas atau direktori yang tidak aktual mengikuti revisi terakhir, maka berkas/direktori tersebut akan diberi keterangan status, seperti removed, modified, added, dan unknown.
  • removed berarti berkas/direktori tersebut tidak ditemukan dalam direktori kerja. Jika Anda melakukan operasi commit, maka berkas/direktori tersebut juga akan dihapus pada revisi terakhir (namun tetap ada pada revisi-revisi sebelumnya)
  • modified berarti berkas tersebut sudah mengalami perubahan
  • added berarti berkas/direktori tersebut adalah berkas/direktori baru yang belum pernah ada di dalam repositori dan akan dimasukkan ke dalam repositori
  • unknown berarti berkas/direktori tersebut tidak ditemukan di dalam repositori dan tidak akan dimasukkan ke dalam repositori pada saat melakukan operasi commit.

Mengatur Nama dan Email

Setiap revisi yang ada akan mengandung informasi pengguna yang membuat revisi tersebut. Untuk mengaturnya, gunakan perintah berikut.
$ bzr whoami "Nama Anda <email@anda.id>"
Untuk mengecek nama yang sedang digunakan, jalankan perintah berikut.
$ bzr whoami
Untuk membuka bzr yang sedang terkunci, jalankan perintah berikut.
$ bzr break-lock  bzr+ssh

Melihat Perubahan

Untuk melihat perubahan yang terjadi antara revisi terakhir yang tersimpan dan revisi yang masih ada dalam direktori kerja Anda, perintah berikut dapat digunakan.
$ bzr diff
Sebuah informasi perubahan dengan format diff akan ditampilkan.
Jika Anda ingin membandingkan dua revisi spesifik, gunakan perintah berikut.
$ bzr diff -rX..Y
Nilai X dan Y menunjuk ke nomor revisi dari revisi yang ingin Anda bandingkan.


sumber: http://dev.blankonlinux.or.id/wiki/Pemaket/Tutorial/PengenalanBazaar

Panduan Pembuatan Paket Ala MOTU

Panduan Pembuatan Paket Ala MOTU

by Daniel Holbach

Kesatu

sudo apt-get install devscripts build-essential 
fakeroot debhelper gnupg pbuilder dh-make

Kedua

nano .bashrc
(tulis pada akhir baris:)
export DEBFULLNAME="Joe Hacker" (sesuaikan dengan nama Anda)
export DEBEMAIL="joe.hacker@isp.com" (sesuaikan dengan e-mail Anda)

Ketiga

source .bashrc
export | grep DEB

Keempat

gpg --gen-key
(buat) 
Real name: Joe Hacker (nama = subjudul kedua)
E-mail address: joe.hacker@isp.com (e-mail= subjudul kedua)
Passphrase: paswordpercobaanjanganditiru

Kelima

source .bashrc
ls
nano .pbuilderrc
(tulis) 
COMPONENTS="main restricted extras extras-restricted"

Keenam

sudo pbuilder create

Ketujuh

wget ftp://ftp.gnu.org/pub/gnu/ed/ed-0.9.tar.bz2
tar xfj ed-0.9.tar.bz2
tar cfz ed_0.9.orig.tar.gz ed-0.9
cd ed-0.9
less COPYING
dh_make -s -c gpl
cd debian
ls
rm *.ex *.EX dirs docs info README.Debian
ls

Kedelapan

nano changelog
(edit dengan susunan sebagai berikut:)
ed (0.9-0ubuntu1) intrepid; urgency=low
 * Initial release.
 * Repacked .tar.bz2 to .tar.gz tarball, no other changes.

Kesembilan

nano control
(ganti) 
Section: editors
(buka file README)
less README
(blok "the standard Unix line editor", 
disalin ke file control untuk mengisi Description singkat.)
(blok "GNU ed is ... Small is Beautiful", 
disalin ke file control untuk mengisi Description panjang.)

Kesepuluh

nano copyright
(isi alamat pengunduhan:) ftp.gnu.org
(buka file AUTHORS, salin dan isi file copyright 
dengan nama-nama pembuat program.)
find . -name '*.c' | xargs head | less
(salin copyright (C) ke file copyright yang menjelaskan 
Copyright.)
(untuk License, ganti kata version 2 dengan version 3. 
Kemudian simpan.)

Kesebelas

cd ..
debuild -S -sa
(akan ditanya passphrase:) passwordpercobaanjanganditiru
cd (kembali ke direktori file dsc ditempatkan)
sudo pbuilder build ed_0.9-0ubuntu1.dsc
less /var/cache/pbuilder/result/ed_0.9-0ubuntu1_i386.deb

Keduabelas

cd /var/cache/pbuilder/result
sudo dpkg -i ed_0.9-0ubuntu1_i386.deb
(Silakan coba:)
 
Sumber: http://dev.blankonlinux.or.id/wiki/
Pemaket/PanduanPembuatanPaketMotu

Senin, 10 Oktober 2011

Remastersys dan Ubuntu 11.10 Oneiric Ocelot


Remastersys dan Ubuntu 11.10 Oneiric Ocelot





Disini saya akan memberikan  informasi mengenai  kombinasi antara Remastersys dan Ubuntu 11.10 Oneiric Ocelot yang dapat berjalan dengan baik dan menjalankan fungsinya dengan benar, tanpa error pada hasil akhir. Secara singkat saya juga akan memberikan  penjelasan mengenai cara memasang remastersys pada sistem ubuntu oneiric ocelot, sebagai catatan disini saya masih menggunakan ubuntu 11.10 versi pengembangan beta 2 yang telah diupdate, karena yang stable belum dirilis secara resmi, meskipun demikian berdasarkan pengalaman menggunakan ubuntu dan remastersys versi sebelumnnya hasil yang didapat akan sama jika cara ini dijalankan pada Ubuntu 11.10 (stable) final version nanti. Bagi yang belum tahu mengenai remastersys bisa membaca eBook saya sebelumnya remastering dengan remastersys.

Sebelumnya untuk memasang remastersys pada ubuntu 11.10 tambahkan secara manual alamat repository remastersys , dengan cara mengedit berkas  yang terletak pada/etc/apt/sources.list , untuk yang menggunakan unity dash Tekan Alt+F2 kemudian ketikan perintah dibawah ini :


gksu gedit /etc/apt/sources.list


Tekan Alt+F2 kemudian edit daftar repositori secara manual
Untuk yang menggunakan terminal bisa menjalankan perintah dibawah ini :


sudo gedit /etc/apt/sources.list


Kemudian setelah berkas sources.list terbuka, tambahkan alamat dibawah ini pada baris paling akhir, untuk lebih jelasnya perhatikan gambar.


# Remastersys
deb http://www.geekconnection.org/remastersys/repository karmic/

Memasang Remstersys - Ubuntu 11.10
Setelah selesai, simpan perubahan yang telah dilakukan, dan tutup berkas sources.list,kemudian jalankan perintah dibawah ini, pastikan sistem telah terkoneksi keinternet untuk mengunduh berkas installer yang dibutuhkan


sudo apt-get update
sudo apt-get install remastersys


Memasang Remstersys - Ubuntu 11.10
Setelah selesai memasang remastersys pada sistem, lanjutkan dengan menginstall frontend ubiquity, jika tidak terinstall live sistem yang telah selesai dibuat tidak akan menampilkan pintasan yang bisa digunakana untuk memasang sistem Ubuntu.
Karena disini Ubuntu yang saya gunakan menggunakan antarmuka standar (gnome) maka yang saya pasang adalah ubiquity-frontend-gtk untuk KUbuntu bisa menggunakanubiquity-frontend-kde.


sudo apt-get install ubiquity-frontend-gtk


Install antarmuka Ubiquity agar Live CD bisa diinstall
Setelah semua proses pemasangan selesai,  remastersys telah siap digunakan pastikan sebelumnya terdapat ruang kosong didirektori /home/ , secara default remastersys menggunakan direktori /home/remastersys sebagai direktori kerja. Untuk membuat salinan sistem yang kita miliki lengkap dengan software tambahan yang telah terpasang tanpa mengikut sertakan berkas dan direktori personal (user) yang berada didirektori home yang digunakan, jalankan remastersys dist

Menjalankan remastersys dengan opsi remastersys dist
Proses remastersys
membuat salinan sistem Ubuntu 11.10 Oneiric Ocelot
Proses ini akan memakan waktu, jadi bisa ditinggal makan, membuat minuman atau tidur :O ,,, setelah semuanya selesai, hasil akhir dari remastersys bisa ditemukan pada direktori/home/remastersys/remastersys/customdist.iso (default path hasil/proses remastersys).

Menjalankan hasil remastersys
dengan KVM/Qemu - 1
Ada baiknya sebelum membakar hasil dari proses remastersys, dicoba terlebih dahulu menggunakan virtual mesin, sebagai contoh disini saya menggunakan Kernel Based Virtual Machine (KVM).

Menjalankan hasil remastersys
dengan 
KVM/Qemu - 2
Sebagai catatan untuk menghindari terjadinya busybox pada hasil akhir dari remastersys, hindari penggunaan custom kernel pada sistem dan gunakan selalu kernel standar dan updatenya dari repository resmi milik ubuntu, kecuali jika anda paham dengan resikonya heheh, Ubuntu 11.10 Oneiric Ocelot sendiri secara resmi telah menggunakan kernel 3.0. 

Demikian penjelasan singkat ini , semoga bermanfaat bagi kawan-kawan semua ... . .